《ALDNOAH.ZERO 第二季》继续了地球与火星之间激烈的战争。火星公主艾瑟依拉姆·薇瑟·艾莉欧斯亚在遭受恐怖袭击后，其车队被误认为地球的宣战行为，导致火星骑士团对地球发动全面攻击。在战争中，斯雷因·特洛耶特，一个于地球出生却在火星长大的少年，选择加入火星一方，成为了一名强大的骑士，驾驶着装甲坐骑在战场上大显身手。

然而，随着战争的持续，艾瑟依拉姆公主逐渐从一个亲善的使者转变为坚定的主战派，她的选择不仅影响了战争的走向，也深刻改变了斯雷因等人的命运。在战火与纷争中，各种复杂的情感与立场交织，构成了一幅宏大的战争画卷。