《超变战陀5百变战陀》的剧情发生在一个陀螺对战风靡全球的时代。一场神秘的“星光雨”赋予了陀螺全新的生命，它们不仅能够在现实中高速旋转，还能在虚拟的对战空间中展现出超乎想象的能力。在这个世界里，陀螺精灵成为了陀螺力量的源泉，它们与陀螺手们共同战斗，创造出无数令人惊叹的陀螺对决。

龙晨，一个热血且自信的少年，意外与来自百变星球的王子成为了朋友。他们携手在地球寻找一种能够唤醒百变星能量的神奇情感能源。然而，这段旅程并非一帆风顺，来自邪恶势力的阻挠以及内心的矛盾与挑战让他们步履维艰。在冒险的过程中，他们结识了性格各异的伙伴，共同成长，一起面对前方的困难与挑战。