《猪猪侠之超星五灵侠 第六季》的剧情围绕着猪猪侠及其伙伴们展开。在这一季中，他们面临着前所未有的挑战——前往武林星收集能量魔方，阻止独孤博士融合星球的阴谋。

猪猪侠和伙伴们来到平安客栈，找到了隐居的武术高手朱大常和朱大婶，并在他们的指导下，学会了打出真气的方法。随后，他们穿梭于武林星的各地，与当地的武术家展开了精彩绝伦的较量，不仅磨练了技艺，也收获了珍贵的魔方。

然而，他们面临的挑战远不止这些。在收集魔方的过程中，他们不断遭遇王霸天设下的重重陷阱。但凭借着坚定的信念和苦练而来的功夫，他们最终成功冲破陷阱，阻止了武林星和猪猪星的融合。然而，胜利的喜悦中，孤独的返场却似乎给了他们致命一击，预示着接下来还有更多的挑战等待着他们。