《奈何公主不好惹》的剧情发生在2023年的中国大陆，讲述了长公主宝珠的传奇故事。宝珠公主因故逃离皇宫，引起了皇帝的极大关注，他命令隐曜门的沈易全力搜寻公主的下落。

在宫外，公主意外地遇到了平民靳九，两人迅速结缘。当沈易找到公主并试图将她带回皇宫时，公主却坚决拒绝，甚至以生命相威胁，誓要与靳九形影不离。沈易无奈，只能将靳九收归隐曜门，让他在宫中作为内侍陪伴公主。

在长公主的庇护下，靳九以假内侍的身份入宫，开始了与公主的冒险生活。原来，靳九接近公主并非偶然，他早有预谋，为的是一件多年前的旧事。随着剧情的深入，公主与靳九的关系逐渐升温，同时也面临着来自皇宫内外的重重挑战和考验。