《阴阳路16：回到武侠时代》的剧情紧凑且充满奇幻色彩。影片设定在2002年的中国香港，但主角毕基与毕仁兄弟二人却意外踏入了时空隧道，瞬间被传送至一千年前的北宋时期。在这个武侠盛行的时代，他们不仅邂逅了梁山好汉如宋江、武松等传奇人物，还卷入了复杂的情感与恩怨纠葛中。

毕基在一次偶然中误踏女尸，出于善心将其安葬，不料因此结识了被西门庆所害却未能报仇的女鬼小倩。梁山因闹鬼事件人心惶惶，毕氏兄弟寄居在武大郎家中，并与武松结为挚友。随后，他们利用现代科技在梁山好汉面前大显身手，被误认为武林高手。

然而，这一切的背后竟是西门庆与黄婆为私会潘金莲而设下的骗局。宋江表面调查闹鬼，实则欲寻回旧爱金莲。当潘金莲决定离开西门庆，回归宋江怀抱时，一场因金钱与情感交织的冲突爆发。武大郎因误食过量摇头丸身亡，武松悲愤之下误杀金莲，随后前往狮子楼向西门庆复仇，毕氏兄弟也义无反顾地加入援助。整个故事在北宋的风云变幻中展开，既融合了武侠的豪迈，又充满了悬疑与惊悚。