《零之使魔》的剧情围绕一个普通高中生平贺才人展开。原本生活在地球日本东京的才人，在去秋叶原维修笔记本电脑的路上，意外触碰了一个类似镜子的奇怪通灵物品，被吸进了名为哈尔凯尼亚的异次元魔法世界。在这个世界里，他被露易丝·法兰西斯·露·布朗·杜·拉·瓦利埃尔——托丽斯汀魔法学院的二年级学生——强迫定下了使魔契约，成为了她的使魔，并被称为“才狗”。

露易丝因魔法糟糕而常被同学取笑，每次施法都以失败和爆炸告终，因此被戏称为“零之露易丝”。尽管才人最初被视为无能的使魔，但他逐渐在异世界结识了许多朋友，并发现了自己能够使用各种武器，包括自己世界的大炮。

在与露易丝共同度过的日子里，两人经历了许多争吵、责备，但也逐渐产生了深厚的感情。在帮助王国消灭了敌国的侵略后，才人和露易丝终于走到了一起。然而，和平并未长久，王国仍处于临战状态，露易丝决定以志愿兵的身份参加前线战斗，而才人也选择留在她身边，共同面对未来的挑战。