《京阪沿线物语欢迎来到古民家民宿》的剧情发生在日本，围绕24岁的新人小说家井町润展开。井町润的首部作品大受欢迎，但随之而来的压力让她在新作品的创作上陷入了困境。为了逃离东京的喧嚣和压力，她决定前往位于京都和大阪之间的京阪电铁“电缆八幡宫山上驿”。

在车站，井町润偶遇了原厨师久我创介和小学生木宫こころ。两人发现了在车站长椅上发呆的井町润，并热情地邀请她前往他们经营的民宿“きずな屋”住宿。这家民宿的经营方针是“一宿一饭之恩”，提供免费住宿和食物，但要求住宿人与店家一起吃饭。

在民宿里，井町润与久我创介和木宫こころ以及其他客人相处愉快。久我创介向她讲述了当地的历史，并安慰她一切都会过去的，井町润感受到了久违的温暖。久我创介也曾有过轻生的念头，但在最后关头被木宫こころ救了下来。店家告诉井町润，在这里住下，愿望就会实现，这让她对下一部作品的创作重新燃起了希望。

在民宿的日子里，井町润的心渐渐成长，她开始积极投入下一部作品的创作中。