电影《怪物》以日本现代都市为背景，讲述了一段关于身份迷失与复仇的故事。主人公是一位平凡的青年，某日突然发现自己拥有了异于常人的超能力。他发现自己可以操纵他人的心智，读取他人的记忆，甚至操控他们的行为。这种能力使他逐渐陷入了道德的灰色地带，他开始用这种能力来满足自己的私欲，甚至走上了犯罪的道路。

然而，就在他自以为掌控了一切的时候，一个神秘组织的出现打破了他的平静生活。这个组织的目标是追踪并消灭所有拥有超能力的人。主人公成为了他们的首要目标。为了生存，他不得不隐藏自己的真实身份，同时努力了解这个神秘组织的真实目的。

在逃亡的过程中，主人公逐渐发现了自己能力背后的真相，以及一个关于自己身世的惊人秘密。原来，他并不是唯一一个拥有超能力的人，而这一切背后隐藏着一个更大的阴谋。为了揭露真相，保护自己和身边的人，主人公决定与神秘组织展开一场生死较量。