《相棒第23季》的剧情围绕警视厅特命系的杉下右京及其团队展开。新一季的故事从右京接到上级命令，着手编写《警视厅150年史》的任务开始。这一任务不仅让右京和他的团队穿梭于警视厅150年的历史长河，更深刻探讨了随时代变迁，“正义”的含义与界限是否也随之演变。

剧情中，明治7年警视厅由原萨摩藩士川路利良创立，他与内务卿大久保利通一起创建了警察机构，就任第一代大警视（现在的警视总监）。然而，大久保后来遭遇了暗杀的悲剧。这样的警察黎明期事件，与后续发生的大人物政治家被杀的事件相呼应，形成了跨越时空的对比。

在探寻过去与现在的交错中，右京和他的团队遭遇了现代日本扩大的“贫富差距”现实，以及在政界蔓延的权力者们的野心和阴谋。一系列谜团与挑战等待着主角们去揭开与克服，剧情在复杂微妙的情感交织与智慧较量中不断推进，为观众呈现了一场视觉与心智的双重盛宴。