《变形金刚：起源》设定在元始天尊化身的赛博坦星球，时间背景为创世十三元祖陨落，御天敌取代前任成为变形金刚领袖后的世界。此时，星球遭受邪恶种族五面怪的统治，内部又因为领导模块丢失而陷入能源危机，唯有靠矿工挖掘能源苦苦支撑。在这样的环境下，年轻的擎天柱（原名奥利安·派克斯）与威震天（原名D-16）作为低级机器人工人，常年生活在赛博坦地底。

擎天柱阳光开朗，富有冒险精神，决定前往地表探索外面的世界。他与威震天、大黄蜂（原名B-127）以及女机器人艾丽塔组成了一支探险小队。在一次探险中，他们遇到了元老级变形金刚钛师傅，钛师傅帮助他们解锁了变形能力，从普通机器人升级成了变形金刚。

然而，随着欲望和权力的膨胀，威震天开始狂妄和残暴，与擎天柱从手足变为仇敌，最终导致了旷日持久的塞伯坦之战。电影展现了擎天柱、威震天以及大黄蜂等角色从低级工人成长并开启变形探险的历程，同时也探讨了权力、压迫与自由等深刻主题。