《长相思 动态漫画》以中国上古时期为背景，描绘了一场跨越人、神、妖三界的爱情传奇。故事中的小夭，原是黄帝女儿轩辕王姬的女儿，因战乱流落民间，隐姓埋名，女扮男装成为一名医师。她在清水镇偶遇了受伤的涂山璟，二人情感渐深。同时，小夭也遇到了九头妖相柳，虽为妖类，却与小夭结下了不解之缘。

在这段冒险中，小夭的身世之谜逐渐揭开，她不仅是黄帝的后代，更是连接人、神、妖三界的关键。而她的表哥玱玹，为了寻找小夭，历经千辛万苦，终于与她重逢。面对家国天下的重任和个人的情感纠葛，小夭做出了艰难的选择，最终帮助玱玹完成了统一大业，与涂山璟一同归隐江湖，留下了一段荡气回肠的千古绝恋。