《超级大坏蛋大战末日集团》的剧情发生在一个充满科技色彩的未来城市。Megamind，一个原本被视为反派的角色，意外地发现了城市面临的新威胁——末日集团的崛起。这个集团由一群拥有高度先进科技的反派组成，他们计划利用这些技术摧毁整个城市。

Megamind意识到，作为曾经的反派，他拥有对抗末日集团的独特视角和经验。他决定暂时放下过去的身份，以保护城市为首要任务。在战斗中，Megamind巧妙地运用智慧和策略，不断破解末日集团的阴谋，逐渐展现出他作为“反派”背后的英雄本色。

随着剧情的推进，Megamind不仅成功阻止了末日集团的毁灭计划，还赢得了市民们的尊敬和爱戴。这部电影通过Megamind的转变，向观众传达了即使是反派也能成为英雄的正能量。