《布莱克书店 第三季》的剧情围绕着一间名为布莱克的独特书店及其两位性格迥异的店员伯纳德和曼尼展开。这一季中，书店陷入了前所未有的困境。伯纳德因为与曼尼的争执，彻底激怒了对方，导致曼尼赌气出走，转而到隔壁新开的明亮整洁的书店工作。

书店内，书籍和垃圾堆积成山，顾客稀少，伯纳德的生活变得一团糟。而曼尼虽然在新书店工作，但内心仍然怀念布莱克书店。他希望伯纳德能主动道歉，给自己一个台阶回归。然而，固执的伯纳德拒绝低头，两人的关系陷入僵局。

面对书店的颓势和与曼尼的僵持，伯纳德的好友弗兰决定出面调解。然而，弗兰自己的生活也面临着挑战，她需要理清自己的问题并重新开始。整个第三季，布莱克书店的命运、伯纳德与曼尼的友情以及弗兰的个人成长交织在一起，构成了一幅充满喜剧色彩的生活画卷。