《等你百年》的剧情发生在中国大陆的某个时代。故事围绕一本旧书展开，书页上记录着五四时期的一段神秘历史。学数学的男生郝欣桐，偶然间发现了这本书，并注意到书页上的另一种笔迹。这引起了他的好奇，他决定寻找笔迹的主人——一位名叫白灿然的历史系女生。

两人开始共同研究这本书，逐渐发现其中隐藏着关于五四运动时期一位重要人物的重要线索。他们深入调查，穿越历史与现实，追寻着这位老校友的革命足迹。正当一切即将水落石出时，白灿然却突然选择放弃，她的决定让郝欣桐感到困惑和不解。

影片以这段跨越时空的追寻为线索，展现了两位年轻人在探寻历史真相过程中的成长与变化，同时也揭示了历史与现实之间的深刻联系。